Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VWC2Q2TAL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms