Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IMPG1Q17R60 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMPG1Q17R60 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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