Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRF1Q16656 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRF1Q16656 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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NRF1Q16656 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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NRF1Q16656 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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NRF1Q16656 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRF1Q16656 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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