Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNXAQ16473 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TNXAQ16473 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNXAQ16473 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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