Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNN3Q15417 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNN3Q15417 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNN3Q15417 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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