Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRRQ15256 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRRQ15256 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRRQ15256 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
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