Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCM1Q15154 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCM1Q15154 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCM1Q15154 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms