Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SYT8-203ENST00000381978 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-209ENST00000519410 705 ntTSL 514.96□□□□□ -0.012e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-208ENST00000476496 969 ntTSL 314.85□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-221ENST00000567935 502 ntTSL 314.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TOP3B-214ENST00000457270 2956 ntTSL 514.77□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-212ENST00000565517 536 ntTSL 414.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-219ENST00000567399 976 ntTSL 514.7□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ABCA2-212ENST00000464876 3438 ntTSL 214.66□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SRRT-214ENST00000614370 556 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MED22-206ENST00000482295 491 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-205ENST00000562310 568 ntTSL 314.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 POLR2I-205ENST00000589069 582 ntTSL 214.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 414.17□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-225ENST00000569245 867 ntTSL 214.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TOP3B-213ENST00000457179 3061 ntTSL 514.04□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-223ENST00000568301 666 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 IL4R-210ENST00000563886 734 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GPS2-214ENST00000574201 550 ntTSL 213.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DPEP1-206ENST00000564645 512 ntTSL 213.83□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 EIF3I-201ENST00000355082 564 ntTSL 313.83□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CACTIN-206ENST00000588749 391 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 513.74□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-203ENST00000517314 654 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-216ENST00000567023 926 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PARK7-206ENST00000465354 949 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SPAG5-214ENST00000582076 719 ntTSL 313.15□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RFXANK-207ENST00000536253 374 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-209ENST00000564068 4204 nt13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DGCR8-206ENST00000485802 555 ntTSL 512.94□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TYRO3-208ENST00000568343 856 ntTSL 512.79□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BORCS7-201ENST00000339834 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-213ENST00000464344 3993 ntTSL 312.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 512.63□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NPR2-205ENST00000464810 3502 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PGC-204ENST00000425343 1152 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 412.34□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PGD-202ENST00000460189 767 ntTSL 212.32□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-211ENST00000455202 2626 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ACACB-214ENST00000544726 678 ntTSL 312.29□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AKR1B10-202ENST00000475559 869 ntTSL 512.28□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TCF19-201ENST00000376255 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AGPAT3-215ENST00000484865 588 ntTSL 212.2□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 EIF3I-205ENST00000483517 744 ntTSL 512.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 IL4R-215ENST00000565915 541 ntTSL 412.09□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 HNRNPL-214ENST00000601813 593 ntTSL 512.09□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NRF1-205ENST00000393232 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CHERP-207ENST00000600432 554 ntTSL 311.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ETV5-204ENST00000422039 564 ntTSL 411.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COPE-205ENST00000595984 434 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 AIFM3-217ENST00000495869 501 ntTSL 411.8□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM32A-202ENST00000585831 896 ntTSL 211.76□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.539e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 IL4R-212ENST00000565179 579 ntTSL 311.71□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 211.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 411.58□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MDH2-202ENST00000424167 681 ntTSL 211.55□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NRF1-204ENST00000393230 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-206ENST00000503121 453 ntTSL 311.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LSM2-212ENST00000477182 767 ntTSL 311.37□□□□□ -0.599e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LSM2-214ENST00000493387 767 ntTSL 511.36□□□□□ -0.599e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 C20orf96-201ENST00000360321 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-208ENST00000468422 531 ntTSL 211.3□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-218ENST00000488567 3854 ntTSL 211.3□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 NRF1-203ENST00000353868 3568 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-211ENST00000601100 609 ntTSL 411.07□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SYNE4-203ENST00000397428 382 ntTSL 311.05□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 52.3
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1804.4 ms