Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2CQ14957 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2CQ14957 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN2CQ14957 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN2CQ14957 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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