Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM25Q14258 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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