Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL3Q13618 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL3Q13618 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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