Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC3Q13507 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC3Q13507 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC3Q13507 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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