Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PICALMQ13492 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PICALMQ13492 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PICALMQ13492 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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