Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSLNQ13421 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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