Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3BPQ13352 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ITGB3BPQ13352 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB3BPQ13352 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB3BPQ13352 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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