Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX10Q13206 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX10Q13206 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDX10Q13206 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
DDX10Q13206 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms