Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1EQ12965 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1EQ12965 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1EQ12965 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1EQ12965 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1EQ12965 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1EQ12965 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYO1EQ12965 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYO1EQ12965 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms