Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFEMP1Q12805 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFEMP1Q12805 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFEMP1Q12805 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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