Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 SHP1YBL058W 1272 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 SNO4YMR322C 714 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 URE2YNL229C 1065 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 SNZ2YNL333W 897 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 HSP33YOR391C 714 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 HSP32YPL280W 714 nt5.6□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 PTK2YJR059W 2457 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 SSK22YCR073C 3996 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 RPR2YIR015W 435 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 CBT1YKL208W 816 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 AMA1YGR225W 1782 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 BUL1YMR275C 2931 nt5.59□□□□□ -1.51
UBX3Q12229 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 TAF4YMR005W 1167 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 PRE2YPR103W 864 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YBR124WYBR124W 360 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 MET7YOR241W 1647 nt5.58□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 EFT2YDR385W 2529 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 EFT1YOR133W 2529 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 STL1YDR536W 1710 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YIL092WYIL092W 1902 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YDR396WYDR396W 501 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YEL074WYEL074W 339 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 THI4YGR144W 981 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 MRPL24YMR193W 777 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 CCZ1YBR131W 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 KTR5YNL029C 1569 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 MDH3YDL078C 1032 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 SEN34YAR008W 828 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YEL020CYEL020C 1683 nt5.56□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 ENT2YLR206W 1842 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 FAT3YKL187C 2253 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 NSI1YDR026C 1713 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 APN1YKL114C 1104 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YLR317WYLR317W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 PFA3YNL326C 1011 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 SHM1YBR263W 1473 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 HSF1YGL073W 2502 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 EIS1YMR031C 2532 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 CDS1YBR029C 1374 nt5.55□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 TEL2YGR099W 2067 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YDL144CYDL144C 1071 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YDR154CYDR154C 351 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 PAN6YIL145C 930 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YJL171CYJL171C 1191 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 YNR048WYNR048W 1182 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 QRI1YDL103C 1434 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 AAP1YHR047C 2571 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 PIF1YML061C 2580 nt5.54□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 NDJ1YOL104C 1059 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 CWC27YPL064C 906 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 MRPL36YBR122C 534 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 TAH18YPR048W 1872 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 NUP1YOR098C 3231 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 QNS1YHR074W 2145 nt5.53□□□□□ -1.52
UBX3Q12229 RET1YOR207C 3450 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YHR140WYHR140W 720 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YIL077CYIL077C 963 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 FHL1YPR104C 2811 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 ALD6YPL061W 1503 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YLH47YPR125W 1365 nt5.52□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 LSM12YHR121W 564 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 TAF11YML015C 1041 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 LST8YNL006W 912 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 DSE3YOR264W 1293 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 CTR1YPR124W 1221 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 PPR1YLR014C 2715 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 snR82snR82 268 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 ERP5YHR110W 639 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 RPS15YOL040C 429 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YOL079WYOL079W 399 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 NPT1YOR209C 1290 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 HAL1YPR005C 885 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 ARR3YPR201W 1215 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 SPC97YHR172W 2472 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 TRK2YKR050W 2670 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 ACF2YLR144C 2340 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 UGO1YDR470C 1509 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 RCK1YGL158W 1539 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 ERG7YHR072W 2196 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 URA7YBL039C 1740 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 PEX7YDR142C 1128 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 SIP2YGL208W 1248 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YKL031WYKL031W 414 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 HCR1YLR192C 798 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 SNN1YNL086W 309 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 SHE10YGL228W 1734 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 BAP2YBR068C 1830 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 RAI1YGL246C 1164 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 SFC1YJR095W 969 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 PGA3YML125C 939 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 YNL234WYNL234W 1281 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 ODC2YOR222W 924 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 PTR2YKR093W 1806 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 CDC10YCR002C 969 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 TRP1YDR007W 675 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 VAM7YGL212W 951 nt5.47□□□□□ -1.53
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