Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YHR127WYHR127W 732 nt6.04□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 STM1YLR150W 822 nt6.04□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 ARA2YMR041C 1008 nt6.04□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 RPO26YPR187W 468 nt6.04□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 DUG1YFR044C 1446 nt6.04□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 IES1YFL013C 2079 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 YMR027WYMR027W 1413 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 LCP5YER127W 1074 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 NME1NME1 340 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 YAP1YML007W 1953 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 DDC1YPL194W 1839 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 GPT2YKR067W 2232 nt6.03□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 SEC18YBR080C 2277 nt6.02□□□□□ -1.44
TY3A-GQ12173 THI21YPL258C 1656 nt6.02□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YGL072CYGL072C 360 nt6.02□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.02□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 MRC1YCL061C 3291 nt6.01□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YGR127WYGR127W 939 nt6.01□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TOS4YLR183C 1470 nt6.01□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 VMS1YDR049W 1899 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 HAS1YMR290C 1518 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 AVO1YOL078W 3531 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YER148W-AYER148W-A 579 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SNZ3YFL059W 897 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SOH1YGL127C 384 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 NCS6YGL211W 1080 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SNZ2YNL333W 897 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SER1YOR184W 1188 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 BUL1YMR275C 2931 nt6□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 UGO1YDR470C 1509 nt5.99□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TKL1YPR074C 2043 nt5.99□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TDH3YGR192C 999 nt5.99□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 PRE7YBL041W 726 nt5.99□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 RER2YBR002C 861 nt5.99□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 PRP24YMR268C 1335 nt5.99□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SIT1YEL065W 1887 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 VHT1YGR065C 1782 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YHR045WYHR045W 1683 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YHL017WYHL017W 1599 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SET5YHR207C 1581 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 FHN1YGR131W 525 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 MRS1YIR021W 1092 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 MTC5YDR128W 3447 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 HSP78YDR258C 2436 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 RPT1YKL145W 1404 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 LAS21YJL062W 2493 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 VPS5YOR069W 2028 nt5.98□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 ERC1YHR032W 1746 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TUB2YFL037W 1374 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 THI4YGR144W 981 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 RMA1YKL132C 1293 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 BUD28YLR062C 378 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SCO2YBR024W 906 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YPR195CYPR195C 330 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 YEL020CYEL020C 1683 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 VPS70YJR126C 2436 nt5.97□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 ICE2YIL090W 1476 nt5.96□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 SSK1YLR006C 2139 nt5.96□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 ATG7YHR171W 1893 nt5.96□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TEF1YPR080W 1377 nt5.96□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TEF2YBR118W 1377 nt5.96□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 PKC1YBL105C 3456 nt5.96□□□□□ -1.45
TY3A-GQ12173 TEL2YGR099W 2067 nt5.96□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YIL077CYIL077C 963 nt5.96□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YJL068CYJL068C 900 nt5.96□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 EFM3YJR129C 1020 nt5.96□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YNR048WYNR048W 1182 nt5.96□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 SUB2YDL084W 1341 nt5.96□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 GEP3YOR205C 1671 nt5.95□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YIL060WYIL060W 435 nt5.95□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 PRP45YAL032C 1140 nt5.95□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YML083CYML083C 1257 nt5.95□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 RPL3YOR063W 1164 nt5.95□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YPR123CYPR123C 435 nt5.95□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YOL036WYOL036W 2286 nt5.94□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 CLB2YPR119W 1476 nt5.94□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 TAX4YJL083W 1815 nt5.94□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 GEX1YCL073C 1848 nt5.93□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YDR134CYDR134C 411 nt5.93□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 UBC4YBR082C 447 nt5.93□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 SMF2YHR050W 1650 nt5.93□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 RPN6YDL097C 1305 nt5.93□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 FAT3YKL187C 2253 nt5.92□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 VPS29YHR012W 849 nt5.92□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 EIS1YMR031C 2532 nt5.92□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YFL042CYFL042C 2025 nt5.91□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 GAT1YFL021W 1533 nt5.91□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 YDR401WYDR401W 564 nt5.91□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 VPS1YKR001C 2115 nt5.91□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 CKB2YOR039W 777 nt5.91□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 VPS4YPR173C 1314 nt5.91□□□□□ -1.46
TY3A-GQ12173 STL1YDR536W 1710 nt5.9□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 BNA5YLR231C 1362 nt5.9□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 GUP2YPL189W 1830 nt5.9□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 UTP9YHR196W 1728 nt5.89□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 YJR012CYJR012C 624 nt5.89□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 OAZ1YPL052W 879 nt5.89□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 CWC27YPL064C 906 nt5.89□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 SNT2YGL131C 4212 nt5.89□□□□□ -1.47
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