Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RASGEF1BQ0VAM2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASGEF1BQ0VAM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms