Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms