Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf54Q08AI8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf54Q08AI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf54Q08AI8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms