Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 JAC1YGL018C 555 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 NSE5YML023C 1671 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 YOS9YDR057W 1629 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 YFL052WYFL052W 1398 nt6.6□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 YDR134CYDR134C 411 nt6.6□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 ATG33YLR356W 594 nt6.6□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 THI21YPL258C 1656 nt6.6□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 OPT1YJL212C 2400 nt6.6□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 GAT1YFL021W 1533 nt6.6□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 PTK2YJR059W 2457 nt6.59□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 VNX1YNL321W 2727 nt6.59□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 ASN2YGR124W 1719 nt6.59□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 FZF1YGL254W 900 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 YNR048WYNR048W 1182 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 RCL1YOL010W 1104 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 AMA1YGR225W 1782 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 ICE2YIL090W 1476 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 ENP1YBR247C 1452 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 YHR045WYHR045W 1683 nt6.58□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 YER186CYER186C 921 nt6.57□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 STL1YDR536W 1710 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 HAS1YMR290C 1518 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 ARO2YGL148W 1131 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 RPB4YJL140W 666 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 PRP45YAL032C 1140 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 PZF1YPR186C 1290 nt6.56□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 MTQ1YNL063W 945 nt6.55□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 VHT1YGR065C 1782 nt6.54□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 ATF1YOR377W 1578 nt6.54□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 PAD1YDR538W 729 nt6.54□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 SGE1YPR198W 1632 nt6.54□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 HSP78YDR258C 2436 nt6.53□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 BUD28YLR062C 378 nt6.53□□□□□ -1.36
CTI6Q08923 SUA5YGL169W 1281 nt6.52□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 YHR145CYHR145C 357 nt6.52□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 RER2YBR002C 861 nt6.52□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 QDR3YBR043C 2070 nt6.52□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 SMF2YHR050W 1650 nt6.52□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 VPS70YJR126C 2436 nt6.51□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 YEH1YLL012W 1722 nt6.51□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 POP1YNL221C 2628 nt6.51□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 SNZ3YFL059W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 SNZ2YNL333W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 UBC4YBR082C 447 nt6.5□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 TAX4YJL083W 1815 nt6.5□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 JIP4YDR475C 2631 nt6.49□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 CBF1YJR060W 1056 nt6.49□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 GEP3YOR205C 1671 nt6.49□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 YIL060WYIL060W 435 nt6.48□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 YJR012CYJR012C 624 nt6.48□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt6.48□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 PRE7YBL041W 726 nt6.48□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 SLD7YOR060C 774 nt6.48□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 SFB3YHR098C 2790 nt6.48□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 ATG23YLR431C 1362 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 MLF3YNL074C 1359 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 ACF2YLR144C 2340 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 UTP7YER082C 1665 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 MIM2YLR099W-A 264 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 RBD2YPL246C 789 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 DRS1YLL008W 2259 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 YFR006WYFR006W 1608 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 MPA43YNL249C 1629 nt6.47□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 TUB2YFL037W 1374 nt6.46□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 EPS1YIL005W 2106 nt6.46□□□□□ -1.37
CTI6Q08923 PAP2YOL115W 1755 nt6.46□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 ATP1YBL099W 1638 nt6.46□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 TDA6YPR157W 1404 nt6.45□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 RPN12YFR052W 825 nt6.45□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 TOM20YGR082W 552 nt6.45□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.45□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 GFD1YMR255W 567 nt6.45□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YOL131WYOL131W 327 nt6.45□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YAP1YML007W 1953 nt6.44□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 NMD5YJR132W 3147 nt6.44□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 REV7YIL139C 738 nt6.44□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.44□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 OAZ1YPL052W 879 nt6.44□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 MKK1YOR231W 1527 nt6.43□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 ALD6YPL061W 1503 nt6.43□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 GYP1YOR070C 1914 nt6.42□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 DED81YHR019C 1665 nt6.42□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YGR127WYGR127W 939 nt6.42□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 SCW4YGR279C 1161 nt6.42□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YPR195CYPR195C 330 nt6.42□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 FET3YMR058W 1911 nt6.42□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 PRP2YNR011C 2631 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 CDC11YJR076C 1248 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 MGR2YPL098C 342 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 RPN6YDL097C 1305 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 YFL034WYFL034W 3222 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 PPR1YLR014C 2715 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 NOP8YOL144W 1455 nt6.41□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 BZZ1YHR114W 1902 nt6.4□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 IPK1YDR315C 846 nt6.4□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 CAB4YGR277C 918 nt6.4□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 ENT2YLR206W 1842 nt6.4□□□□□ -1.38
CTI6Q08923 TEF1YPR080W 1377 nt6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.3 ms