Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 YDL114WYDL114W 927 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SHO1YER118C 1104 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 RRP46YGR095C 672 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YGR176WYGR176W 348 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 RRP4YHR069C 1080 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SEC13YLR208W 894 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 ODC2YOR222W 924 nt5.52□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 TEA1YOR337W 2280 nt5.51□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.51□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YDR396WYDR396W 501 nt5.51□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 ERG3YLR056W 1098 nt5.51□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YLR118CYLR118C 684 nt5.51□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 NRD1YNL251C 1728 nt5.51□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 KDX1YKL161C 1302 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 KNH1YDL049C 807 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SFC1YJR095W 969 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 STM1YLR150W 822 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 TFS1YLR178C 660 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 PSH1YOL054W 1221 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 HPF1YOL155C 2904 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 FRE3YOR381W 2136 nt5.5□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 TRP1YDR007W 675 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 PHB1YGR132C 864 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SSY5YJL156C 2100 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 PIN2YOR104W 849 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YCL041CYCL041C 495 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SHM1YBR263W 1473 nt5.49□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 EIS1YMR031C 2532 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 GDB1YPR184W 4611 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YER186CYER186C 921 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 PRM10YJL108C 1152 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 PRS1YKL181W 1284 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YNL165WYNL165W 1221 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 APE3YBR286W 1614 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SEC12YNR026C 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 RAT1YOR048C 3021 nt5.48□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 PDH1YPR002W 1551 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 RTT106YNL206C 1368 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 LYS12YIL094C 1116 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 DJP1YIR004W 1299 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 GFD1YMR255W 567 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SSO1YPL232W 873 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 KTR3YBR205W 1215 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 TIM54YJL054W 1437 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YDR109CYDR109C 2148 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 SOG2YOR353C 2376 nt5.47□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 GIT1YCR098C 1557 nt5.46□□□□□ -1.53
RPN8Q08723 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 MHR1YDR296W 681 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 PUS5YLR165C 765 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 HOR7YMR251W-A 180 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YNL108CYNL108C 813 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YJR015WYJR015W 1533 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 RPT4YOR259C 1314 nt5.46□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 NUD1YOR373W 2556 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 HEM3YDL205C 984 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YGL072CYGL072C 360 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 RHO3YIL118W 696 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 MPM1YJL066C 759 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YJR115WYJR115W 510 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YKL151CYKL151C 1014 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YBR226CYBR226C 411 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 SNU71YGR013W 1863 nt5.45□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YFL052WYFL052W 1398 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 KSS1YGR040W 1107 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 TAX4YJL083W 1815 nt5.44□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 SPT3YDR392W 1014 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 PHO86YJL117W 936 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 SKG1YKR100C 1068 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YMR010WYMR010W 1218 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YNR042WYNR042W 429 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 CCZ1YBR131W 2115 nt5.43□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 ORC5YNL261W 1440 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 VAM7YGL212W 951 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YIL060WYIL060W 435 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 APS3YJL024C 585 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 MRPL13YKR006C 795 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 COX17YLL009C 210 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 COX11YPL132W 903 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 CDC16YKL022C 2523 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 PRP46YPL151C 1356 nt5.42□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 SIP5YMR140W 1470 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 RRP45YDR280W 918 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YER010CYER010C 705 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YLR194CYLR194C 765 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 BUD9YGR041W 1644 nt5.41□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 YDL121CYDL121C 450 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 COX26YDR119W-A 201 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 APN1YKL114C 1104 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 HCR1YLR192C 798 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 TFB4YPR056W 1017 nt5.4□□□□□ -1.54
RPN8Q08723 SRP101YDR292C 1866 nt5.4□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 FET3YMR058W 1911 nt5.4□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 NOB1YOR056C 1380 nt5.4□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 SEC20YDR498C 1152 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 SLO1YER180C-A 258 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 FHN1YGR131W 525 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YLL059CYLL059C 507 nt5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms