Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFRSF9Q07011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF9Q07011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms