Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBQ06643 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBQ06643 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBQ06643 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBQ06643 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBQ06643 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBQ06643 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBQ06643 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTBQ06643 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBQ06643 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBQ06643 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBQ06643 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBQ06643 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LTBQ06643 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTBQ06643 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LTBQ06643 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LTBQ06643 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LTBQ06643 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBQ06643 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBQ06643 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBQ06643 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBQ06643 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBQ06643 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LTBQ06643 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LTBQ06643 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LTBQ06643 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LTBQ06643 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBQ06643 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBQ06643 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBQ06643 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBQ06643 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LTBQ06643 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBQ06643 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBQ06643 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBQ06643 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBQ06643 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBQ06643 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBQ06643 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms