Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKCZQ05513 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKCZQ05513 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKCZQ05513 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms