Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSBP1Q04837 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSBP1Q04837 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SSBP1Q04837 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms