Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNC4Q03721 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNC4Q03721 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms