Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2BQ02880 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOP2BQ02880 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOP2BQ02880 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOP2BQ02880 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOP2BQ02880 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms