Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ID3Q02535 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ID3Q02535 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ID3Q02535 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ID3Q02535 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ID3Q02535 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ID3Q02535 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ID3Q02535 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ID3Q02535 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ID3Q02535 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ID3Q02535 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ID3Q02535 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ID3Q02535 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ID3Q02535 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms