Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFAP4Q01664 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFAP4Q01664 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP4Q01664 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TFAP4Q01664 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TFAP4Q01664 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TFAP4Q01664 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TFAP4Q01664 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TFAP4Q01664 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TFAP4Q01664 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP4Q01664 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP4Q01664 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP4Q01664 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP4Q01664 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP4Q01664 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP4Q01664 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP4Q01664 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP4Q01664 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP4Q01664 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP4Q01664 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP4Q01664 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TFAP4Q01664 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TFAP4Q01664 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFAP4Q01664 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFAP4Q01664 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFAP4Q01664 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TFAP4Q01664 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms