Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A2Q01362 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A2Q01362 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms