Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MDM2Q00987 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MDM2Q00987 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms