Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms