Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPS25P82663 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPS25P82663 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPS25P82663 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms