Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TMF1P82094 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMF1P82094 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMF1P82094 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMF1P82094 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TMF1P82094 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMF1P82094 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TMF1P82094 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TMF1P82094 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMF1P82094 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TMF1P82094 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMF1P82094 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TMF1P82094 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TMF1P82094 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TMF1P82094 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMF1P82094 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TMF1P82094 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMF1P82094 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMF1P82094 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMF1P82094 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMF1P82094 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMF1P82094 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMF1P82094 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMF1P82094 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMF1P82094 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMF1P82094 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMF1P82094 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMF1P82094 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TMF1P82094 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMF1P82094 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TMF1P82094 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
TMF1P82094 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMF1P82094 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMF1P82094 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMF1P82094 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMF1P82094 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMF1P82094 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TMF1P82094 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TMF1P82094 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TMF1P82094 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TMF1P82094 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMF1P82094 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMF1P82094 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMF1P82094 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMF1P82094 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMF1P82094 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMF1P82094 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms