Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX1P78414 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX1P78414 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX1P78414 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX1P78414 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX1P78414 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX1P78414 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX1P78414 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX1P78414 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX1P78414 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX1P78414 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX1P78414 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX1P78414 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX1P78414 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX1P78414 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX1P78414 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX1P78414 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX1P78414 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX1P78414 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX1P78414 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX1P78414 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX1P78414 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX1P78414 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX1P78414 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX1P78414 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX1P78414 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX1P78414 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX1P78414 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX1P78414 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms