Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IRX6P78412 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IRX6P78412 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IRX6P78412 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IRX6P78412 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IRX6P78412 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IRX6P78412 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IRX6P78412 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IRX6P78412 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IRX6P78412 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IRX6P78412 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IRX6P78412 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IRX6P78412 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IRX6P78412 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IRX6P78412 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IRX6P78412 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IRX6P78412 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IRX6P78412 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IRX6P78412 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX6P78412 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX6P78412 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX6P78412 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX6P78412 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX6P78412 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IRX6P78412 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IRX6P78412 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRX6P78412 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX6P78412 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX6P78412 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX6P78412 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX6P78412 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX6P78412 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX6P78412 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX6P78412 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX6P78412 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX6P78412 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX6P78412 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
IRX6P78412 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX6P78412 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX6P78412 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX6P78412 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX6P78412 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX6P78412 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX6P78412 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX6P78412 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX6P78412 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX6P78412 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX6P78412 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms