Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPNP63162 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPNP63162 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms