Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSNL1P62760 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSNL1P62760 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSNL1P62760 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms