Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVFRD-1P60508 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVFRD-1P60508 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms