Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTENP60484 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTENP60484 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTENP60484 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTENP60484 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTENP60484 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTENP60484 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTENP60484 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTENP60484 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTENP60484 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTENP60484 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTENP60484 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTENP60484 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTENP60484 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTENP60484 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTENP60484 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTENP60484 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTENP60484 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTENP60484 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTENP60484 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTENP60484 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTENP60484 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTENP60484 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTENP60484 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTENP60484 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTENP60484 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTENP60484 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTENP60484 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTENP60484 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTENP60484 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PTENP60484 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTENP60484 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTENP60484 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTENP60484 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTENP60484 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTENP60484 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTENP60484 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTENP60484 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTENP60484 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTENP60484 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTENP60484 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTENP60484 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTENP60484 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms