Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP4BP1P59074 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP4BP1P59074 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms