Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB25P57735 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB25P57735 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB25P57735 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB25P57735 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB25P57735 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB25P57735 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB25P57735 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB25P57735 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB25P57735 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB25P57735 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB25P57735 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB25P57735 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB25P57735 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB25P57735 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB25P57735 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB25P57735 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB25P57735 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB25P57735 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB25P57735 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB25P57735 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB25P57735 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB25P57735 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB25P57735 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB25P57735 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB25P57735 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB25P57735 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms