Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME5P56597 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NME5P56597 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME5P56597 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME5P56597 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME5P56597 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME5P56597 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME5P56597 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME5P56597 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME5P56597 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME5P56597 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME5P56597 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME5P56597 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME5P56597 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NME5P56597 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME5P56597 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME5P56597 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME5P56597 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME5P56597 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME5P56597 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME5P56597 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME5P56597 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME5P56597 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME5P56597 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME5P56597 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME5P56597 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME5P56597 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME5P56597 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME5P56597 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME5P56597 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME5P56597 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NME5P56597 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME5P56597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME5P56597 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME5P56597 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME5P56597 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME5P56597 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME5P56597 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME5P56597 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME5P56597 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME5P56597 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME5P56597 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME5P56597 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms