Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTBP2P56545 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms