Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD23BP54727 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD23BP54727 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD23BP54727 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.7 ms