Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 LYS12YIL094C 1116 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 SKG1YKR100C 1068 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 URE2YNL229C 1065 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YNL285WYNL285W 372 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 DSE3YOR264W 1293 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 YPK2YMR104C 2034 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 DIA3YDL024C 1407 nt5.91□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 HIR1YBL008W 2523 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 RPS5YJR123W 678 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 JNM1YMR294W 1122 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 NDJ1YOL104C 1059 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 CKA2YOR061W 1020 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 MRPL36YBR122C 534 nt5.9□□□□□ -1.46
YNL058CP53947 KEX2YNL238W 2445 nt5.9□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 ATH1YPR026W 3636 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YBR138CYBR138C 1575 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SNF3YDL194W 2655 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 PHO86YJL117W 936 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 ISY1YJR050W 708 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 GCV3YAL044C 513 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 TAL1YLR354C 1008 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 ALD6YPL061W 1503 nt5.89□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 ERC1YHR032W 1746 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YNL095CYNL095C 1929 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YDL129WYDL129W 876 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 RAI1YGL246C 1164 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 DOT5YIL010W 648 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 NPA3YJR072C 1158 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 CLB1YGR108W 1416 nt5.88□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YIL067CYIL067C 2037 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YME1YPR024W 2244 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 RPT6YGL048C 1218 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YLR463CYLR463C 552 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 PET20YPL159C 762 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 ALG5YPL227C 1005 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 APM4YOL062C 1476 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 GIT1YCR098C 1557 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 CNM67YNL225C 1746 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 MAL11YGR289C 1851 nt5.87□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YJR115WYJR115W 510 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 QRI5YLR204W 336 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 PSE1YMR308C 3270 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SFB3YHR098C 2790 nt5.86□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 UBA1YKL210W 3075 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 PRP40YKL012W 1752 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 MID1YNL291C 1647 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YTA12YMR089C 2478 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 snR78snR78 87 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 RPL12AYEL054C 498 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YEL074WYEL074W 339 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 CHO1YER026C 831 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YHL018WYHL018W 363 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YLR184WYLR184W 348 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YNL194CYNL194C 906 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 PFA3YNL326C 1011 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 NPT1YOR209C 1290 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SSK22YCR073C 3996 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 HSF1YGL073W 2502 nt5.85□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SKS1YPL026C 1509 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 SUM1YDR310C 3189 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 APL6YGR261C 2430 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 RPN5YDL147W 1338 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 CLP1YOR250C 1338 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 IDP1YDL066W 1287 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 RME1YGR044C 903 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YML018CYML018C 1182 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YOL131WYOL131W 327 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 RDL1YOR285W 420 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 CTR1YPR124W 1221 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 YEH1YLL012W 1722 nt5.84□□□□□ -1.47
YNL058CP53947 IPK1YDR315C 846 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 KSS1YGR040W 1107 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 LEU5YHR002W 1074 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 MRI1YPR118W 1236 nt5.83□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ADE13YLR359W 1449 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 APE3YBR286W 1614 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 RPS16BYDL083C 432 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YER010CYER010C 705 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 MMS2YGL087C 414 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 IMA1YGR287C 1770 nt5.82□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 DIT1YDR403W 1611 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 MKK2YPL140C 1521 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 BUD32YGR262C 786 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 LSM12YHR121W 564 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 MRPS5YBR251W 924 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 GUS1YGL245W 2127 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 EPS1YIL005W 2106 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ATP1YBL099W 1638 nt5.81□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 GPA2YER020W 1350 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ELP2YGR200C 2367 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms